Wasserlinsen Software

Parameter auf einen Blick

	Zählen aller Fronds (Auch Überlappungen)
	Biologisch richtige Trennung von Fronds
	Erkennen und löschen von Artefakten
	Arbeiten mit Sedimenten und gefärbten Lösungen
	Größenverteilung
	Farbklassifizierung
	Blattindex
	Unterscheidung gesund - krank
	Statistische Auswertung
	Testreihenmanagement
	Export zu BioStat
	Export Report als xsl, txt, htm
	Export Bilder bmp, gif, jpg, tif
	Mikrotiterplatten und Screening mit bis zu 1000 Mikrotiterplatten möglich (Automatisches Anfahren der Proben)

Leistungen der Analysesoftware

Entfernung von Hintergrundobjekten

Bei der Aufnahme von Gefäßen mit Wasserlinsen müssen alle sichtbaren Objekte außer den Wasserlinsen aus dem Analysebild entfernt werden. Dabei handelt es sich um die Ränder des Gefäßes, Spiegelungen von Wasserlinsen an der Glaswand, Wurzeln, Beugungsränder des Becherbodens oder z. B. Sediment. Diese werden automatisch erkannt und entfernt. Sollte dies mit Hilfe der angebotenen Methoden nicht vollständig möglich sein, weil z. B. ein neuer Gefäßtyp verwendet wurde, können die Methoden assistentengestützt leicht optimiert und gespeichert werden.

Erkennung der einzelnen Fronds/Sprosse

Der LemnaTec Scanalyzer separiert aus der komplexen Kolonienstruktur die einzelnen Fronds und macht sie für eine individuelle Analyse zugänglich. Auch hier garantiert eine differenzierte Formerkennung die biologisch richtige Trennung und Randerfassung der Fronds. Die fertig konfigurierten Auswertungsmethoden können bei Bedarf leicht selbst optimiert werden. Einzelne Fehler bei der Fronderkennung lassen sich durch eine komfortable, intuitiv gestaltete Korrekturoberfläche gegebenenfalls manuell beheben. Dabei können Fronds gelöscht, geteilt, vereinigt oder hinzugefügt werden.

Farbklassifizierung

Durch ein mehrstufiges Verfahren, bei dem der Anwender in einer intuitiven Benutzeroberfläche Farben zu Farbklassen (z.B. Hellgrün, Gelb, etc.) oder auch zu Bonitierungsklassen (z.B. gesund, nekrotisch, chlorotisch) als Falschfarbenbild zusammenstellt, wird die visuelle Bonitierung nachgebildet. Die Bonitierung erfolgt dann automatisch und ordnet die Farben reproduzierbar, schnell und bequem in Farb- oder Bonitierungsklassen ein. Die Farben können direkt aus den Bildern entnommen und als Farbschemata für weitere Analysen abgespeichert werden. Bei der Erstellung neuer Farbschemata sind Originalbild und Falschfarbenbild nebeneinander sichtbar.

Das Originalbild eines Wasserlinsentests mit gesunden und nekrotischen Fronds. Der LemnaTec Scanalyzer erkennt alle Fronds und markiert sie entsprechend.

So erkennt man sofort die Auswirkung von Schemaveränderungen. Auf diese Weise kann der visuelle Eindruck und die Bewertung des Anwenders im Computer reproduzierbar quantifiziert aber auch jederzeit verändert werden.

Aus dem Kantenbild kann auch ein Falschfarbenbild generiert werden. So werden Effekte besser sichtbar.

Die so festgelegte Farbklassifizierung wird sowohl auf die Gesamtfläche aller Fronds als auch auf jeden Frond einzeln angewendet.

Datenauswertung Einzelbild

Zum flexiblen Arbeiten - besonders in der Forschung - können Einzelbilder von Testansätzen bildanalytisch ausgewertet werden. Für jeden einzelnen Frond liegt nach der Bildanalyse ein detaillierter Datensatz zur Fläche, Farbe und Form der Wasserlinsen vor. Dieser wird für eine Reihe von Standardanwendungen ausgewertet. Da die Daten ex-portierbar sind, lassen sich flexibel weitere Auswertungen anschließen. Neben der Anzahl der Fronds und der Gesamtfläche kann aus der Farbklassenverteilung der Gesamtfläche eine kompakte Darstellung desvisuellen Eindrucks eines Testansatzes dokumentiert werden.

Neben Wachstumsgeschwindigkeit und Farbveränderungen kann auch die Frondgröße durch das Testgut beeinflußt werden. Hier zeigt die Größenverteilung der Fronds (als Fläche oder Anzahl) objektiv die Reaktion der Wasserlinsen. Durch Kombination von Größenverteilung und Farbklassifizierung lassen sich auch physiologische Biomarker wie z. B. das bevorzugte Absterben großer Fronds sehr einfach feststellen und dokumentieren.Diese erste Datenauswertung wird graphisch dargestellt. Die ent-sprechenden Tabellen und Bilder sind exportierbar.

Testreihenmanagement und Auswertung

Der Normalfall der Anwendung des LemnaTec Scanalyzers ist der Routinebetrieb mit Messreihen, die entsprechend internationaler Normen häufig zwei- bis vierfach ausgewertet und dokumentiert werden müssen.

Alle Teilschritte des gesamten Biotests werden durch den Scanalyzer unterstützt. So können alle für einen normkonformen Test zu protokollierenden Daten eingegeben und später mit ausgedruckt werden. Der Verdünnungsassistent hilft beim Ansetzen von Konzentrationsreihen und bei der Probenbenennung. Von den Einzelansätzen jedes Tests können zu jedem Testzeitpunkt Aufnahmen in beliebiger Reihenfolge gemacht werden, die dann klar sortiert als Datenfiles abgespeichert werden. Die Identifizierung der Testansätze ist mit einem Barcodescanner komfortabel automatisierbar. Der Messreihenassistent sorgt für die nötige Übersicht bei der Qualitätskontrolle. Die Ergebnisse der Einzelparameter stehen am Testende als Übersicht mit Vorschaugraphiken und als Datenfiles exportfähig zur Weiterbearbeitung bereit.

Die bequemste Auswertung erfolgt mit dem separaten Auswertungspaket LemnaStat, welches alle Messdaten normkonform einschließlich der statistischen Auswertung bis zur Angabe von EC- und NOEC-Werten weiterbearbeitet. LemnaStat kann auch ohne Scanalyzer für Biotestauswertungen eingesetzt werden.

Alle Daten werden in einer übersichtlichen Form aufbereitet und als Report ausgegeben. Dabei werden auch bisher nicht zugängliche Daten wie die Größenverteilung angegeben.

Dokumentation

Alle Bilder und Daten werden so gespeichert, dass jederzeit alle angewandten Methoden und die manuellen Eingriffe rückverfolgbar dokumentiert werden können. Dies erlaubt eine umfassende Qualitätskontrolle z. B. nach der guten Laborpraxis (GLP). Alle Bilder sind zur individuellen Dokumentation exportierbar.

Perspektiven

Die Quantifizierung von Flächen, Formen und Farben ist auch bei zahlreichen weiteren Biotests notwendig. Bitte fragen Sie uns nach dem aktuellen Stand der Entwicklungen.